ITBI pode ter duplicidade ?

ITBI é pago a cada vez que houver venda do imóvel.

Sim.

O Imposto sobre Transmissão de Bens e Imoveis é calculado em nome daquele que está comprando um imovel, caso tenha sido preenchido com o nome errado, ou em nome de outro pode sim ser gerado novo ITBI com os dados e nome correto para assim seguir com seu pagamento. Quando preenchido erroneamente e logo em seguida preenchido um nome ITBI esse correto pode ser pagado desconsiderando o pagamento do outro, automaticamente o outro será desconsiderado pelo sistema da prefeitura. Verifique sempre na prefeitura de sua cidade e/ou municipio pois cada prefeitura aplica um criterio diferente.

Poder não pode, mas acontece que as vezes foi deixado de dar baixa em alguma ITBI antiga.

Não pode. ITBI incide na transferência de titularidade.

ITBI é um imposto pago toda vez que o imóvel for transferido para outro proprietário.

ITBI é devido na tradição da coisa, ou seja, por exemplo A vendeu para B, B deve recolher o ITBI em seu nome, inclusive, posteriormente ou simultaneamente pedindo atualização cadastral no IPTU para o nome de B.

O ITBI é registrado no nome de pessoal física então pode sim ter uma duplicidade, se caso acontecer você deve gerar um novo ITBI com o nome correto e deve ser desconsiderado o anterior.