Se pagar o ITBI a maior do que o necessário o registro ocorre ?

Deve solicitar restituição na Prefeitura.

Sim, não cabe ao cartório calcular o ITBI, mas nesse caso você pode pedir restituição na prefeitura.

Solicitar a restituição dos valores pagos. Processo administrativo no SAV - Processo virtual.

Sim.

Peça devolução.

Sim, e você pode solicitar a restituição do valor na prefeitura.

Devo pagar o imposto sobre a transmissão de imóvel antes do registro da compra e venda prática comum do Comércio de compra e venda de imóveis e assistência de pagamento do ITBI antes do registro da compra na matrícula do imóvel junto ao cartório de imóveis.

Não, não sairá mais rápido, ITBI é apenas o imposto pago para que haja a transmissão do imóvel, o processo é lento, afinal, você não quer comprar um imóvel hoje e começa a reforma, se mudar e depois descobri que não é seu por motivo de bloqueio, estelionato ou outros.